Les prémonitions du patriote William Milton Cooper n'ont pas failli lorsque au sujet des attentats du 11 septembre il tentait d'élucider la question « A qui profite le crime ? » : 
« La réponse est évidente et très dérangeante. Tout le monde dans les affaires du pétrole tirera avantage de la situation, surtout la famille Bush et ses associés. Tout le complexe industriel de la défense sera gagnant. Les Nations Unies y trouveront leur compte. L'État d'Israël exploitera amplement le drame. La tyrannie au nom de la sécurité trouvera sa justification et gouvernera les citoyens américains. Et ne soyez pas surpris si beaucoup de Patriotes et Américains politiquement incorrects commencent à disparaître pendant la nuit comme les Juifs et les Tsiganes en Allemagne Nazie.  »

Connu sous le nom de Bill Cooper, l'auteur du livre traduit en français « Le Gouvernement Secret - l'origine, l'identité et le but du MJ 12 » a été tué à la suite d'une fusillade avec les adjoints du shérif à Eagar. Un adjoint a, quant à lui, reçu deux coups de feu à la tête, et a été transporté dans un état critique à l'hôpital de Phoenix.

La famille de Cooper déclare que sa mort n'est apparemment pas en rapport avec son opposition au gouvernement fédéral, mais qu'elle est intervenue à la suite d'un mandat d'arrêt pour « attaques réalisées dans des circonstances aggravantes » et deux chefs d'accusation pour « mis en danger d'autrui ». Cooper avait déclaré à de nombreuses reprises sur son site Web et dans son émission radio qu'il ne se rendrait pas à police. La police a pris ses déclarations pour argent comptant et la confrontation a commencé le 5 novembre à approximativement 12h15. C'est seul dans sa maison en Arizona que Cooper fut tué le 5 novembre 2001 à l'âge de 58 ans, puisque dés mars 1999 il avait renvoyé sa famille en dehors des États-Unis. 

W.M. Cooper servit avec le Strategic Air command jusqu'à 1965. Il fut aussi officier naval dans la Navy jusqu'en 1975 où il accéda à des documents classés Top Secret.

W.M. Cooper était animateur d'une émission de la radio chrétienne WCR (Worldwide Christian Radio). Il était bien connu pour ses visions radicales dans le domaine ufologique. Il battit sa réputation sur l'idée que plusieurs espèces étrangères, et aux intentions peu recommandables, sont présentes sur notre planète.

Il mena une enquête qui le conduit à identifier Whitley Strieber comme un agent de la CIA. Il considérait que Art Bell, animateur d'une émission consacrée au paranormal, à la parapsychologie et au New Age, était un partisan de la conspiration du nouvel ordre mondial. Il considérait la plupart des spécialistes des OVNI, y compris Stanton Friedman et Linda Moulton Howe, comme des agents d'une conspiration visant à dissimuler les extraterrestres afin qu'ils puissent réaliser leur plan sans être dérangé par une quelconque résistance humaine. Il alla jusqu'à déclarer que JFK fut assassiné par le conducteur de sa voiture parce qu'il voulait faire des révélations publiques au sujet des OVNI, à savoir que nous avions des bases sur la Lune et sur Mars depuis les années 50.

Il produit un document, prétendument daté de 1981, qui révélait que Whitley Strieber ainsi que Richard Hoagland et plusieurs autres individus furent « activés » dans le cadre d'un programme gouvernemental appelé le « Projet Permettez » (Project Enable).

Richard Hoagland est un des plus virulents apôtres de la thèse qui soutient une connexion entre les pyramides égyptiennes, les monuments mégalithiques anglais et les édifices supposés artificiels de la planète Mars, sur le site de Cydonia. Ce fut l'objet du projet « Mission indépendante sur Mars », soutenu par le SRI entre 1983 et 1984. Le Stanford Research Institute (SRI) est un institut de recherche californien lié aux services de renseignements américains et au Pentagone avec lequel il réalise 75% de ses recettes. L'institut mènera de nombreuses recherches sur le site de Gizeh, cherchant des chambres secrètes dans les monuments égyptiens. Alors que les fouilles entreprises par le SRI débutèrent en 1973, il est intéressant de noter que parallèlement l'institut se voit aussi associé à des études d'un tout autre ordre lancées par le Pentagone et la CIA. Ils se nomment le projet Grill Frame, le projet Sun Streak et le projet Star Gate, et ce sont des expériences de vision à distance qui débutèrent en 1974 comme nous l'apprend en 1990 la loi sur la liberté d'information en vigueur aux Etats-Unis. La vision à distance permet un déplacement hors du corps et quelques fois hors du temps qui nous permet de nous retrouver à des endroits ou/et des époques différentes de celle dans laquelle subsiste notre enveloppe charnelle, ainsi qu'un retour au point de départ.

En 1988 les travaux de Hoagland sont relancés dans le cadre de la « Mission Mars », rebaptisée ultérieurement « Mission Entreprise ». Il affirme que les formations martiennes cachent un code qui nous aidera à mettre au point des « technologies radicalement nouvelles » pour nous connecter aux autres dimensions de notre univers. Hoagland soutiendra cette thèse au siège de l'ONU à New York en février 1992, et participa à de nombreuses reprises aux émissions de l'Art Bell Radio qui touchent 15 millions d'auditeurs et consistent en « un mélange de conservatisme et de crédulité New Age. »1  

Un rapport bénéficiant d'un financement occulte de la part du SRI, Changing Images of Man de O.W. Marley et Willis Harman, fut rendu publique la même année qui vit le démarrage des fouilles à Gizeh par l'institut et son implication dans les expériences de vision à distance, à savoir 1973. Ce rapport conclut que des « nouvelles valeurs » (soif de spiritualité, souci de l'écologie, développement personnel, etc.) devraient se répandre dans la société et saper « la culture de la société industrielle moderne », occasionner des troubles sociaux et se traduire par un déclin économique, une inflation galopante et un effondrement des institutions. Il conviendrait donc, selon les auteurs, de s'en remettre aux traditions de la franc-maçonnerie afin d'éviter cette décadence.

Bien qu'ayant toujours tendance à accuser ceux qui ne pensaient pas comme lui d'être des agents de la CIA, il révisa sa position sur l'hypothèse extraterrestre. Un de ses amis, Norio Hayakawa, révèle qu'il commençait à supposer que :

Cette hypothèse se confirmerait à la vue des déclarations messianique de l' « agent » Hoagland lorsqu'il évoque le possible décodage des soi-disant messages martiens : « Les éventuelles « technologies radicales » susceptibles d'être mises au point grâce au « message de Cydonia » peuvent aider le monde à opérer une transition spectaculaire vers un véritable « nouvel ordre mondial », sinon vers un Nouveau Monde au sens littéral du terme. »2

La menace d'une conspiration extraterrestre distillée par la désinformation que constituent les fuites des services secrets ne serait qu'un leurre visant à justifier l'unification des gouvernements et le renforcement des moyens de contrôle sur la population. Il me semble qu'un tel revirement de position nous fait passer d'un extrême à un autre, et que la vérité doit certainement se trouver quelque part entre les deux.

W.M. Cooper était connu pour être le premier à avoir fourni les preuves de la présence d'explosifs à l'intérieur du Murrah Building dans la Ville d'Oklahoma le 19 avril 1995, ainsi que du type d'explosif utilisé.

W.M. Cooper avait passé le dernier mois à mettre en doute les explications du gouvernement au sujet de ce qui a causé la destruction du World Trade Center le 11 septembre.